H. Tsugawa, K. Ikeda, M. Takahashi, A. Satoh, Y. Mori, H. Uchino, N. Okahashi, Y. Yamada, I. Tada, P. Bonini, Y. Higashi, Y. Okazaki, Z. Zhou, Z.-J. Zhu, J. Koelmel, T. Cajka, O. Fiehn, K. Saito, M. Arita, M. Arita: A lipidome atlas in MS-DIAL 4. Nature Biotechnology 38 (2020) 1159–1163. IF = 36.558 DOI
Zpracování přístrojových souborů získaných během necílené metabolomické a lipidomické analýzy představuje náročný úkol. Odhaduje se, že lze anotovat pouze 20 procent signálů („features“) získaných během necílených metod využívajících kapalinovou chromatografii s hmotnostní spektrometrií (LC–MS). MS-DIAL představuje uživatelsky přívětivý software s otevřeným přístupem pro zpracování přístrojových souborů získaných během necílených metabolomických a lipidomických analýz. Nejnovější verze obsahuje atlas (databázi) 117 lipidových podtříd s predikovanými retenčními časy, tandemovými hmotnostně-spektrometrickými spektry (MS/MS) a kolizními průřezy (CCS) pro anotaci komplexních lipidů v biologických vzorcích. Použitím MS-DIAL 4 je dosaženo vyšší míry anotace komplexních lipidů v biologických vzorcích ve srovnání s jinými softwarovými programy v této oblasti, což umožňuje smysluplnější interpretaci dat.