Metabolismus bioaktivních lipidů
Na této straně najdete
O oddělení
Cílem laboratoře je objasnit, jak metabolity ovlivňují funkci orgánů, příjem živin, komunikaci mezi orgány a fyziologii jater a tukové tkáně. Současné projekty se zabývají komplikacemi diabetu 2. typu, metabolismem tukové tkáně, srdečním selháním, různými druhy rakoviny a kachexií a zahrnují oblasti fyziologie, chemie a bioinformatiky. Základní odborné znalosti zahrnují experimenty in vivo na myších (infuze, clampy, dietní experimenty) a experimenty na buněčných kulturách (subcelulární metabolomika, fluxomika). Laboratoř se specializuje na analýzu polárních metabolitů, jednoduchých a komplexních lipidů a lipidových mediátorů, jako jsou FAHFA, pomocí pokročilých metod založených na hmotnostní spektrometrii. Pracovní postupy integrují různé omické techniky, včetně metabolomiky, lipidomiky, transkriptomiky a analýzy metabolických toků, podporované specializovanými bioinformatickými nástroji vyvinutými v laboratoři.
V případě zájmu o Bc., Mgr., Ing. nebo Ph.D. práci v oblasti biochemie, analytické chemie, fyziologie nebo příbuzných oborů pošlete, prosím, email ohledně možných témat a jejich vypsání. Témata se dynamicky mění.
GTTAtlas - interaktivní metabolomický a lipidomický atlas myších tkání během orálního glukózového tolerančního testu (OGTT)
MetaboAtlas21 - zevrubný atlas myšího metabolomu a lipidomu.
LORA - a Lipid Over-Representation Analysis tool.
Spal svůj tuk - metabolické procesy hrou!
Představujeme jedinečnou deskovou hru „Spal svůj tuk“, která zábavnou formou přibližuje biochemické procesy metabolismu lipidů a glukózy. Tato strategická hra umožňuje hráčům ponořit se do fascinujícího světa molekul a energetických procesů lidského těla. Hráči ve dvou týmech spolupracují, aby rozložili nahromaděný tuk na vodu a oxid uhličitý, a získali molekuly ATP – klíčového zdroje energie v těle.
Hra je navržena tak, aby i složité biochemické pojmy byly srozumitelné a přístupné. S minimálními náklady na materiál – stačí vytisknout herní plán, vyrobit hrací figurky a žetony na 3D tiskárně a koupit hrací kostky – přináší tato aktivita možnost zapojit studenty středních i vysokých škol a návštěvníky popularizačních vědeckých akcích do metabolických přeměn. Hra pomáhá rozvíjet týmovou spolupráci, laterární myšlení, a zvyšuje povědomí o zdravotních tématech, jako je obezita.
Herní materiály jsou dostupné na internet na adrese: https://github.com/IPHYS-Bioinformatics/Burn_your_fat
Jste připraveni dominovat herní desce? „Spal svůj tuk“ je zábava, učení a zdraví v jednom – ideální pro školy, univerzity i vědecké veletrhy.
Projekty
Úspěchy
Ondřej Kuda obdržel Cenu ministra školství, mládeže a tělovýchovy
RNDr. Ondřej Kuda, Ph.D., vedoucí oddělení metabolismu bioaktivních lipidů ve Fyziologickém ústavu AV ČR obdržel 20. listopadu 2023 Cenu ministra školství za mimořádné výsledky výzkumu, experimentálního vývoje a inovací. Cena byla udělena za výsledky výzkumu nových signálních lipidových molekul, které potlačují zánět a zlepšují metabolismus glukózy u pacientů s cukrovkou.
Publikace
Brejchová; Kristýna - Rahm; Michal - Beňová; Andrea - Domanská; Veronika - Reyes Gutierrez; Paul Eduardo - Džubanová; Martina - Trubačová; Radka - Vondráčková; Michaela - Čajka; Tomáš - Tencerová; Michaela - Vrábel; Milan - Kuda; Ondřej Uncovering mechanisms of thiazolidinediones on osteogenesis and adipogenesis using spatial fluxomics. Metabolism-Clinical and Experimental. 2025; 166(May); 156157.
IF = 10.9
Kozlov; O. - Lísa; M. - Riečan; Martin - Kuda; Ondřej Chiral supercritical fluid chromatography-mass spectrometry with liquid chromatography fractionation for the characterization of enantiomeric composition of fatty acid esters of hydroxy fatty acids. Analytica Chimica Acta. 2025; 1345(1 April); 343735.
IF = 5.7
Riečan; Martin - Domanská; Veronika - Lupu; C. - Patel; M. - Vondráčková; Michaela - Rossmeisl; Martin - Saghatelian; A. - Lupu; F. - Kuda; Ondřej Tissue-specific sex-dependent difference in the metabolism of fatty acid esters of hydroxy fatty acids. Biochimica Et Biophysica Acta-Molecular and Cell Biology of Lipids. 2024; 1869(8); 159543.
IF = 3.9
Parchem; K. - Letsiou; S. - Petan; T. - Oskolkova; O. - Medina; I. - Kuda; Ondřej - O'Donnell; V. B. - Nicolaou; A. - Fedorova; M. - Bochkov; V. - Gladine; C. Oxylipin profiling for clinical research: Current status and future perspectives. Progress in Lipid Research. 2024; 95(July); 101276.
IF = 14.0
Jadhav; Sukanya B. - Vondráčková; Michaela - Potomova; Petra - Sandoval-Acuna; Cristian - Šmigová; J. - Klanicova; Kristyna - Rosel; D. - Brabek; J. - Štursa; Jan - Werner; Lukáš - Truksa; Jaroslav NDRG1 acts as an oncogene in triple-negative breast cancer and its loss sensitizes cells to mitochondrial iron chelation. Frontiers in Pharmacology. 2024; 15(JUN 25 2024); 1422369.
IF = 4.4
Fotogalerie oddělení
Lidé
Vedoucí oddělení
Zástupce vedoucího oddělení
Pracovníci oddělení
