Membránový transport
Na této straně najdete
Pozorování transportéru sodných a draselných kationtů v buňkách kvasinek pomocí fluorescenčního mikroskopu. Zeleně je označen protein nacházející se v plasmatické membráně buněk, červeně je označena membrána vakuoly.
O oddělení
Studujeme proteiny transportující látky a signály přes buněčné membrány. Tyto proteiny, nazývané transportéry, zajišťují přísun živin do buněk, odstraňování odpadních látek z buněk a také komunikaci s okolním prostředím. Při studiu transportérů živočišných, zejména lidských, a rostlinných buněk využíváme převážně modelový eukaryotní mikroorganismus – kvasinky (konvenční, nekonvenční i patogenní druhy).
Zabýváme se výzkumem v těchto oblastech:
- Struktura, funkce a regulace aktivity buněčných transportních systémů na úrovni molekul proteinů
- Regulace dopravy a uspořádání nově syntetizovaných transportérů v plasmatické membráně buněk
- Úloha transportérů ve specifických vlastnostech buněk a při vzniku onemocnění
- Úloha transportérů v pathogenicitě a virulenci kvasinek rodu Candida
- Vývoj metodik pro stanovení fyziologických parametrů na buněčné úrovni
Aktuální projekty
Úspěchy
Zapojení do projektu "Otevřená věda"
Naše oddělení se dlouhodobě zapojuje do projektu Otevřená věda, který je organizován Akademií věd ČR, v.v.i. a má za úkol přilákat na vědecká pracoviště nadějné studenty středních škol. O přínosu a úspěšnosti projektu Otevřená věda nejvíce vypovídají rozhovory se studenty, kteří u nás stáže absolvovali a my jsme tak stáli na začátku jejich úspěšných životních cest.
Denis Cmunt začínal svoji vědeckou kariéru coby středoškolský student na našem oddělení membránového transportu. Nástupem na vysokou školu prohloubil spolupráci formou bakalářské práce a v současné době působí již jako PhD student na univerzitě ve Švýcarském Lausanne. Zde si můžete přečíst inspirující rozhovor s Denisem.
Nátálie Pořízková je další úspěšnou studentkou, která docházela na naše oddělení v průběhu svého středoškolského studia. Natálie získala na závěrečné konferenci projektu Otevřená věda první cenou v kategorii Živá příroda/Lékařské vědy a Biochemie. V současné době Nátálie nastoupila na 3. lékařskou fakultu Univerzity Karlovy. Držíme ji palce a přejeme hodně úspěchu.
Současné poznatky o membránovém transportu v kvasinkách jsou shrnuty v nové knize.
Nová kniha shrnující současné znalosti týkající se transportu látek přes cytoplasmatickou membránu kvasinkových buněk.
José Ramos, Hana Sychrová, Maik Kschischo
Úspěšná česko-belgická spolupráce s laboratoří Dr. Pierra Morsomma z Katolické university v Lovani.
Anne-Sophie Colinet
Úšpěšná spolupráce s belgickou skupinou Dr. Pierra Morsomma z Katolické university v Lovani byla završena šestitýdenní stáží studentky Anne-Sophie Colinet na našem pracovišti. V rámci společného projektu s Dr. Morsommem se snažíme objasnit mechanismus transportu přenašeče Ca2+ Gdt1 v Golgiho aparátu v kvasince S. cerevisiae. Gdt1 je homologní protein k produktu lidského genu TMEM165, jehož nefunkčnost je spojována s poruchami glykosylace a tudíž s dědičným onemocněním CDG typu II (Congenital Disorders of Glycosylation). Hlavním úkolem pobytu belgické studentky bylo měření vnitobuněčné pH v kvasince S. cerevisiae postrádající gen kódující Ca2+ přenašeč Gdt1.
Hledáme antifungální léčiva v rámci evropského konsorcia
Od 1. října 2013 jsme zahájili práci na novém evropském projektu nazvaném Molecular Mechanisms of Human Fungal Pathogen Host Interaction (ImResFun, FP7-PEOPLE-2013-ITN ) a pod dobu 4 let se budeme v konsorciu devíti laboratoří a tří firem z devíti evropských zemí věnovat studiu interakce patogenních kvasinek s buňkami, orgány a tkáněmi hostitele. Naším cílem bude identifikovat v patogenních kvasinkách dosud neznámé cíle pro vývoj nových antifungálních léčiv.
Publikace
Papoušková; Klára - Gómez; M. - Kodedová; Marie - Ramos; J. - Zimmermannová; Olga - Sychrová; Hana Heterologous expression reveals unique properties of Trk K+ importers from nonconventional biotechnologically relevant yeast species together with their potential to support Saccharomyces cerevisiae growth. Yeast. 2023; 40(2); 68-83.
IF = 2.6
Brockhurst; M. - Cavet; J. - Diggle; S. P. - Grainger; D. - Mangenelli; R. - Sychrová; Hana - Martin-Verstraete; I. - Welch; M. - Palmer; T. - Thomas; G.H. Shaping microbiology for 75 years: highlights of research published in Microbiology. Part 1 – Physiology and growth. Microbiology. 2023; 169(6); 001356.
IF = 2.8
Zimmermannová; Olga - Velázquez; Diego - Papoušková; Klára - Průša; Vojtěch - Radová; Viktorie - Falson; P. - Sychrová; Hana The Hydrophilic C-terminus of Yeast Plasma-membrane Na+/H+ Antiporters Impacts Their Ability to Transport K+. Journal of Molecular Biology. 2024; 436(4); 168443.
IF = 5.6
Masaryk; Jakub - Kale; Deepika - Pohl; Pavel - Ruiz-Castilla; F. J. - Zimmermannová; Olga - Obšilová; Veronika - Ramos; J. - Sychrová; Hana The second intracellular loop of the yeast Trk1 potassium transporter is involved in regulation of activity; and interaction with 14–3-3 proteins. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2023; 21(April); 2705-2716.
IF = 6.0
Mane; S. - Pathan; E. - Tupe; S. - Deshmukh; S. - Kale; Deepika - Ghormade; V. - Chaudhari; B. - Deshpande; M. Isolation and Characterization of Chitosans from Different Fungi with Special Emphasis on Zygomycetous Dimorphic Fungus Benjaminiella poitrasii: Evaluation of Its Chitosan Nanoparticles for the Inhibition of Human Pathogenic Fungi. Biomacromolecules. 2022; 23(3); 808-815.
IF = 6.2